“Respublika Narkoloji Mərkəzi” Publik Hüquqi Şəxsində aşağıda göstərilən struktur bölgüsü mövcuddur:
1. İdarəetmə aparatı
2. Təsərrüfat heyəti
3. Konsultativ-poliklinika şöbəsi
4. Təşkilati-metodik şöbəsi
5. Ambulator reabilitasiya şöbəsi
Fəaliyyət göstərən şöbələr:
1. Qəbul şöbəsi
2. I şöbə
3. II şöbə
4. III şöbə(qadın)
5. IV şöbə
6. V şöbə
7. İxtisaslaşdırılmış şöbə
8. İntensiv terapiya şöbə
9. Kiniki diaqnostik və biokimyəvi labarotoriya
10. Şüa diaqnostikası şöbəsi
11. Fizioterapiya və tibbi bərpa şöbəsi
12. Aptek
“Respublika Narkoloji Mərkəzi” publik hüquqi şəxsində ambulator məcburi narkoloji tibbi yoxlama komissiyası keçirilir. Hər gün (24 saat) 2 məntəqədə sərxoşluq hallarının bütün növlərinin təyini məqsədi ilə tibbi müayinə aparılır.
Pasientlərin yanaşı xəstəlikləri olduğu halda konsultativ poliklinika şöbəsində terapevt, stomatoloq, ümumi cərrah, psixiatr, nevropatoloq, dermotoveneroloq, kardioloq, infeksionist kimi mütəxəssislər müayinə və müalicə aparırlar. “Respublika Narkoloji Mərkəzi” publik hüquqi şəxsində İİV infeksiyasi üzrə könüllü məsləhət və müayinə kabineti fəaliyyət göstərir.